MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 85222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009943	TTTTA	2	10	7	16	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009943	A	6	6	65	70	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
3	NC_009943	AAC	2	6	104	109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158520018
4	NC_009943	ATG	2	6	113	118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520018
5	NC_009943	A	6	6	191	196	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
6	NC_009943	C	7	7	282	288	0 %	0 %	0 %	100 %	158520018
7	NC_009943	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
8	NC_009943	AC	4	8	347	354	50 %	0 %	0 %	50 %	158520018
9	NC_009943	GTG	2	6	446	451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520018
10	NC_009943	TC	3	6	529	534	0 %	50 %	0 %	50 %	158520018
11	NC_009943	CCGG	2	8	538	545	0 %	0 %	50 %	50 %	158520018
12	NC_009943	CCA	2	6	580	585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
13	NC_009943	AGCCC	2	10	595	604	20 %	0 %	20 %	60 %	158520018
14	NC_009943	GGA	2	6	631	636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520018
15	NC_009943	ACC	2	6	665	670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
16	NC_009943	GCG	2	6	678	683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520018
17	NC_009943	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158520018
18	NC_009943	TGC	2	6	717	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520018
19	NC_009943	AGG	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520018
20	NC_009943	TGG	3	9	780	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520018
21	NC_009943	CCGA	2	8	804	811	25 %	0 %	25 %	50 %	158520018
22	NC_009943	TGC	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520018
23	NC_009943	GCC	2	6	876	881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520018
24	NC_009943	CAC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
25	NC_009943	ACC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
26	NC_009943	CCTG	2	8	1065	1072	0 %	25 %	25 %	50 %	158520018
27	NC_009943	CAT	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520018
28	NC_009943	GGT	2	6	1165	1170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520018
29	NC_009943	GCC	2	6	1190	1195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520018
30	NC_009943	TGC	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520018
31	NC_009943	TAT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520018
32	NC_009943	A	6	6	1431	1436	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
33	NC_009943	CT	3	6	1453	1458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009943	TTC	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009943	T	6	6	1492	1497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009943	T	6	6	1499	1504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009943	T	6	6	1514	1519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009943	AATTT	2	10	1520	1529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009943	ACC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009943	C	6	6	1628	1633	0 %	0 %	0 %	100 %	158520019
41	NC_009943	CAC	2	6	1686	1691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520019
42	NC_009943	ACG	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520019
43	NC_009943	CCG	3	9	1730	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
44	NC_009943	CTGC	2	8	1740	1747	0 %	25 %	25 %	50 %	158520019
45	NC_009943	GTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
46	NC_009943	GGGATC	2	12	1836	1847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158520019
47	NC_009943	CGG	2	6	1857	1862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
48	NC_009943	TGG	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
49	NC_009943	T	6	6	2006	2011	0 %	100 %	0 %	0 %	158520019
50	NC_009943	GCC	2	6	2032	2037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
51	NC_009943	GGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
52	NC_009943	GCGG	2	8	2071	2078	0 %	0 %	75 %	25 %	158520019
53	NC_009943	CAG	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520019
54	NC_009943	TGC	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520019
55	NC_009943	ATT	2	6	2152	2157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520019
56	NC_009943	ACC	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520019
57	NC_009943	GAC	2	6	2308	2313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520019
58	NC_009943	GGC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
59	NC_009943	GC	3	6	2326	2331	0 %	0 %	50 %	50 %	158520019
60	NC_009943	ATT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520019
61	NC_009943	A	6	6	2411	2416	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
62	NC_009943	CGG	3	9	2441	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
63	NC_009943	TGC	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520019
64	NC_009943	GC	3	6	2474	2479	0 %	0 %	50 %	50 %	158520019
65	NC_009943	A	6	6	2504	2509	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
66	NC_009943	GCC	2	6	2512	2517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
67	NC_009943	GCC	2	6	2569	2574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
68	NC_009943	GTG	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
69	NC_009943	TGG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
70	NC_009943	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
71	NC_009943	GGC	2	6	2854	2859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
72	NC_009943	CGGCAT	2	12	2877	2888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158520019
73	NC_009943	GCGGA	2	10	2921	2930	20 %	0 %	60 %	20 %	158520019
74	NC_009943	GCTGAT	2	12	2931	2942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158520019
75	NC_009943	GCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
76	NC_009943	A	6	6	2952	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
77	NC_009943	ATG	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520020
78	NC_009943	GGC	2	6	3141	3146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520020
79	NC_009943	CCTG	2	8	3183	3190	0 %	25 %	25 %	50 %	158520020
80	NC_009943	AT	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	158520020
81	NC_009943	TGG	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520021
82	NC_009943	CCGGC	2	10	3340	3349	0 %	0 %	40 %	60 %	158520021
83	NC_009943	CGG	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520021
84	NC_009943	GGC	2	6	3477	3482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520021
85	NC_009943	CAG	2	6	3552	3557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520021
86	NC_009943	GC	3	6	3596	3601	0 %	0 %	50 %	50 %	158520021
87	NC_009943	TGG	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520021
88	NC_009943	T	6	6	3906	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	158520021
89	NC_009943	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	158520021
90	NC_009943	GC	3	6	3940	3945	0 %	0 %	50 %	50 %	158520021
91	NC_009943	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520021
92	NC_009943	CT	3	6	4017	4022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009943	A	7	7	4057	4063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009943	AAT	2	6	4069	4074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158520022
95	NC_009943	CCG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
96	NC_009943	GGC	2	6	4166	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
97	NC_009943	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520022
98	NC_009943	CGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
99	NC_009943	TTG	2	6	4248	4253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520022
100	NC_009943	GA	3	6	4278	4283	50 %	0 %	50 %	0 %	158520022
101	NC_009943	GCC	2	6	4329	4334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
102	NC_009943	GGC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
103	NC_009943	CCA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520022
104	NC_009943	CCA	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520022
105	NC_009943	GCCAC	2	10	4533	4542	20 %	0 %	20 %	60 %	158520022
106	NC_009943	CTG	2	6	4637	4642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
107	NC_009943	GCT	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
108	NC_009943	GCT	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
109	NC_009943	GCC	2	6	4754	4759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
110	NC_009943	TGAGC	2	10	4813	4822	20 %	20 %	40 %	20 %	158520022
111	NC_009943	CAG	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
112	NC_009943	T	6	6	5049	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	158520022
113	NC_009943	CTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520022
114	NC_009943	GCC	2	6	5097	5102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
115	NC_009943	G	6	6	5143	5148	0 %	0 %	100 %	0 %	158520022
116	NC_009943	TCC	2	6	5226	5231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158520022
117	NC_009943	ACG	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
118	NC_009943	CGGA	2	8	5308	5315	25 %	0 %	50 %	25 %	158520022
119	NC_009943	GCA	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
120	NC_009943	TTC	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158520022
121	NC_009943	CCG	2	6	5382	5387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
122	NC_009943	CGG	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
123	NC_009943	ATG	2	6	5406	5411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520022
124	NC_009943	GCA	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
125	NC_009943	GTC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
126	NC_009943	GGTG	2	8	5470	5477	0 %	25 %	75 %	0 %	158520022
127	NC_009943	GCCG	2	8	5500	5507	0 %	0 %	50 %	50 %	158520022
128	NC_009943	GCG	2	6	5508	5513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
129	NC_009943	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520022
130	NC_009943	CAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
131	NC_009943	GAG	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520022
132	NC_009943	CGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
133	NC_009943	GGT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520022
134	NC_009943	GCC	2	6	5732	5737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
135	NC_009943	T	7	7	5755	5761	0 %	100 %	0 %	0 %	158520022
136	NC_009943	ACC	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009943	GCT	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520023
138	NC_009943	GAT	3	9	5920	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520023
139	NC_009943	TTG	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520023
140	NC_009943	CAC	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520023
141	NC_009943	TGG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520023
142	NC_009943	CCA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520023
143	NC_009943	ATC	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520023
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149	NC_009943	GCTG	2	8	6672	6679	0 %	25 %	50 %	25 %	158520023
150	NC_009943	CG	3	6	6727	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	158520023
151	NC_009943	AGC	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520023
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156	NC_009943	GGC	2	6	6904	6909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520023
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168	NC_009943	AAAAAC	2	12	7263	7274	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_009943	TCG	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520024
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179	NC_009943	GAAAA	2	10	7642	7651	80 %	0 %	20 %	0 %	158520024
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182	NC_009943	GGC	2	6	7754	7759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_009943	TCG	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_009943	GCC	2	6	7872	7877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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225	NC_009943	GTC	2	6	9276	9281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520027
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241	NC_009943	CCT	2	6	9778	9783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
242	NC_009943	ATA	2	6	9789	9794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009943	AAATCG	2	12	9881	9892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_009943	ATCGGG	2	12	9901	9912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_009943	CAA	2	6	9932	9937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_009943	TTC	2	6	9945	9950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_009943	TTC	2	6	9962	9967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_009943	GAA	2	6	10043	10048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_009943	G	6	6	10057	10062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
250	NC_009943	CGC	2	6	10083	10088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
251	NC_009943	ATCGGG	2	12	10095	10106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_009943	TTC	2	6	10156	10161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_009943	CAA	3	9	10264	10272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_009943	A	8	8	10271	10278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009943	T	7	7	10303	10309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009943	T	6	6	10346	10351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009943	TCA	2	6	10459	10464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520028
258	NC_009943	CAT	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520028
259	NC_009943	ATC	2	6	10571	10576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520028
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262	NC_009943	GGCT	2	8	10741	10748	0 %	25 %	50 %	25 %	158520028
263	NC_009943	TCG	2	6	10806	10811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520028
264	NC_009943	CCG	2	6	10818	10823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520028
265	NC_009943	GTCAT	2	10	10842	10851	20 %	40 %	20 %	20 %	158520028
266	NC_009943	CCCAG	2	10	10879	10888	20 %	0 %	20 %	60 %	158520028
267	NC_009943	GAT	2	6	10997	11002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520028
268	NC_009943	CGG	2	6	11026	11031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520028
269	NC_009943	GCA	2	6	11047	11052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520028
270	NC_009943	AGA	3	9	11075	11083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158520028
271	NC_009943	TGT	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520028
272	NC_009943	CAGC	2	8	11104	11111	25 %	0 %	25 %	50 %	158520028
273	NC_009943	GGCC	2	8	11113	11120	0 %	0 %	50 %	50 %	158520028
274	NC_009943	GTA	2	6	11153	11158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520028
275	NC_009943	CAT	2	6	11185	11190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520028
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282	NC_009943	ATG	2	6	11367	11372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520028
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291	NC_009943	CTTGTG	2	12	11724	11735	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
292	NC_009943	GAT	2	6	11738	11743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_009943	CCG	2	6	11835	11840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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296	NC_009943	TGT	2	6	11917	11922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_009943	GAT	2	6	12027	12032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520029
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392	NC_009943	AT	3	6	16743	16748	50 %	50 %	0 %	0 %	158520031
393	NC_009943	T	6	6	16784	16789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_009943	CGA	2	6	16812	16817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_009943	GGC	2	6	16875	16880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_009943	CGC	2	6	16903	16908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
397	NC_009943	CCCG	2	8	17007	17014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
398	NC_009943	A	6	6	17069	17074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_009943	GCA	2	6	17208	17213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520032
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401	NC_009943	GTC	2	6	17271	17276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520032
402	NC_009943	TCG	2	6	17302	17307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520032
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419	NC_009943	TGT	2	6	17923	17928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_009943	ACT	2	6	17994	17999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520033
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440	NC_009943	GC	3	6	18646	18651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
441	NC_009943	GTTAT	2	10	18655	18664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009943	AAAC	2	8	18760	18767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
443	NC_009943	TCTT	2	8	18807	18814	0 %	75 %	0 %	25 %	158520034
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